Het basisteam van TFDT stelt jaarlijks een Jaarprogramma vast. De voortgang wordt periodiek gerapporteerd.

Het basisteam komt wekelijks bij elkaar. Voor het opstellen van de adviezen worden werkgroepen samengesteld.

TFDT richt zich op projectadviezen en het beantwoorden van kennisvragen. Er wordt overleg gevoerd met de waterschappen/HWBP om de vraag aan TFDT te definiëren. Vervolgens wordt in een aantal sessies het advies uitgewerkt. Hierbij wordt nauw samengewerkt met de waterschappen om zo te borgen dat het advies aansluit op de vraag. De uitgebrachte adviezen worden gepresenteerd aan het projectteam van desbetreffend waterschap

TFDT heeft vanaf het ontstaan tot op heden meerdere adviezen opgesteld.

Opdrachtgevers zijn, naast de diverse waterschappen, ook verschillende diensten van Rijkswaterstaat, Natuurmonumenten en de Programmadirectie HWBP.